各界的质疑是：西子湾沙滩会馆在海边的中山大学校区内，车队在晚上八点十分进入大学校门后，右边是山，左边是海，只有一条小路前往会馆，这段路，在维安上来说，纵深拉得很长，不易防守，只要十几个人就可以阻挡去路。果然一百多位抗议者聚集在这条小路，就搞得张志军的车队前后被切断，第一辆前导车和第二辆陆委会副主委张显耀的座车已经进入西子湾沙滩会馆，张志军的座车却不得不在距离会馆只有150公尺和100公尺处两度停止前进，然后就遭到「黑色岛国青年阵线」和「民主黑潮学生联盟」共二十几位成员伏击，他们在暗夜中，从抗议群众的后面，把装有白漆的夹链袋丢向座车并洒冥纸，跟在车旁小跑步的随扈和警察都被波及，随后警察动手抓人，随扈则严密护送张志军进入会馆。
事发之后，惊动两岸高层，台湾各单位竞相卸责，高雄市警方说，当天下午接到陆委会担心的电话后，就把警力从162人增加到378人；但陆委会质疑高雄市警方在西子湾部署的警力不足，也没有划设「陈情抗议区」，发生泼漆事件后才紧急征调警力支持。高雄市警局还说，他们只负责车队的前导车和垫后车，至于中间的主宾车辆为什么停下来，他们也不知道，也不知道中间的车队由谁指挥。
当天深夜，陆委会和国台办在高雄圆山饭店紧急开会到凌晨两点半，敲定了脱离的战术，第二天中午结束和胡志强市长的会晤之后，陆委会对外宣称，张志军将前往彰化鹿港天后宫参加祭拜仪式，车队上了高速公路后也的确往南行驶，前往彰化，但却在中途分成两个小车队，一个由国台办交流局局长领军继续前往天后宫出席活动，另一个搭载张志军的车队则在下了交流道之后，一百八十度大回转，重新开上高速公路，往北直奔桃园机场，就这样，张志军连离台记者会都没有召开，就匆匆离境。
事发的当天晚上，台湾陆委会副主委张显耀曾向高雄市警方抱怨说，「大陆人已经不相信我们了」，透露出泼漆事件已经对两岸造成深远的影响。